Государственный музей истории и культуры Ферганской области – один из старейших музеев Узбекистана. Основой для его создания стала выставка промышленности сельского хозяйства, проведенная в 1884 году в доме губернатора. Через год музею выделили 4 комнаты на втором этаже губернаторского дома. В 1899 году музей был официально открыт как «Народный музей Ферганской области» и в его фондах уже тогда насчитывалось более 2000 экспонатов и книг.

В 1911 году, в связи с тяжелым материальным положением в стране, музей был закрыт. Его заново открыли в 1920 году, а в 1938 году он получил статус «областного краеведческого музея». С 1985 года музей располагается в новом современном специально построенном здании. На данный момент в нем представлена экспозиция, отражающая историю Ферганской долины с древности и до начала XX века, а также демонстрирующая природу региона.

Сегодня в музее функционируют пять отделов (история, природа, искусство, научно-просветительский и фонд) и 10 депозитариев (изобразительное искусство, металлические и керамические изделия, специальный, документы, газеты и плакаты, изделия из дерева, археология и нумизматика, природа, фотонегативы и снимки). В фондах музея собрана богатая коллекция предметов, относящихся ко всем периодам истории и культуры региона. Общее количество экспонатов превышает 80 тысяч единиц хранения.

В конце XIX – начале XX века археологическая часть музейного собрания пополнялась в основном случайными находками. В 1928 году в музей поступили высокохудожественные медные предметы и керамические фрагменты, найденные в убранствах гробниц XII века в Узгане. В 1939-1940 годах была организована экспедиция археологического надзора за грандиозным строительством Большого, Южного и Северного Ферганских каналов. Штаб этой экспедиции располагался в здании Ферганского музея. В результате в музейную коллекцию были переданы десятки археологических находок, обнаруженных в ходе строительства. Особую ценность представляют керамические сосуды, датируемые первыми веками до нашей эры, найденные в Толмазаре. В 1950-1952 годах в музей поступили другие предметы, найденные в гробнице Боркорбаз, на небольшом руднике в городе Кува и на городище Мугпаша. Все эти артефакты были переданы сотрудниками Памиро-Ферганской генеральной археолого-этнографической экспедиции.

С 1950 года музей начинает активно заниматься археологическими исследованиями. Эти работы проводились выпускниками Ленинградского университета, а позже сотрудниками музея Н.Г. Горбуновой и Б.З. Гамбургом. В период с 1951 по 1956 год фонды музея пополнились более чем 3000 археологических предметов. В 1962-1986 годах Ферганский областной краеведческий музей проводил совместные экспедиции с Государственным Эрмитажем (Россия). В настоящее время музей сотрудничает с Институтом археологии Академии наук Республики Узбекистан, а основная часть предметов поступает из самостоятельных раскопок, проводимых сотрудниками музея на различных объектах. Особенно важные исследования продолжаются в Куве – крупнейшем городе региона. На сегодняшний день археологическая коллекция Ферганского музея насчитывает более 11 тысяч экспонатов.