Национальный исторический музей Кыргызской Республики был основан в 1925 году. Современное здание музея, ранее являвшееся филиалом Центрального музея В.И. Ленина, было передано Историческому музею в 1991 году. С 2016 по 2020 год музей находился на реконструкции, а в 2021 году новая экспозиция вновь открыла свои двери для посетителей.

В настоящее время музейные фонды насчитывают около 100 тысяч предметов, имеющих историческую ценность. Здесь представлены археологические и этнографические коллекции, а также материалы, освещающие процесс государственного строительства, развитие и достижения Кыргызстана в сферах экономики, науки и культуры.

Создание историко-археологического отдела связано с именем ленинградского ученого-археолога А.Н. Бернштама. В 1941 г. под его руководством была открыта первая научная экспозиция по истории Кыргызстана с II тыс. до н.э. до начала ХХ в.

Гордостью музея являются его археологические коллекции, одна из которых - памятники древнетюркской каменной скульптуры, включает более 50 экспонатов. Эти скульптуры представлены как в основной экспозиции, так и на открытой площадке рядом с музеем. Коллекция достаточно разнообразна: от лицевых изваяний на каменных плитах и валунах до высокохудожественных скульптур - настоящих произведений искусства.

Комплектование коллекции изваяний музея началось в 40-е годы XX века и продолжается в настоящее время. Первые три скульптуры были доставлены в музей А.Н. Бернштамом в 1941 году из Чуйской долины.  В 60-е годы в музей поступили 19 изваяний от Кыргызского Республиканского добровольного общества охраны памятников истории и культуры из разных регионов страны. В 1979 году, в результате работы совместной археологической экспедиции Института истории АН Киргизской ССР и Государственного исторического музея Киргизской ССР под руководством Д.Ф. Винника, в музей поступило 20 каменных скульптур, собранных в Иссык-Кульской области. Уникальная коллекция из пяти каменных изваяний и трех поминальных оградок была передана в музей в октябре 1992 г. участниками археологической экспедиции в Нарынской области под руководством К.Ш. Табалдиева. Кроме того, музейная коллекция продолжает пополняться за счет приобретения каменных скульптур у населения. В 2017 году в дар музею был передан уникальный памятник — женское изваяние в «трехрогой» короне.